เจ้าหน้าที่สืบสวนอัคคีภัยคือผู้ที่ตรวจสอบสาเหตุของการเกิดเพลิงไหม้และบันทึกทำเป็นโปรไฟล์ นานาเสะ เจ้าหน้าที่สืบสวนอัคคีภัยได้ช่วยบุคคลหนึ่งในสถานที่เกิดเหตุเพลิงไหม้เอาไว้เมื่อนานมาแล้ว ซึ่งนั่นเองที่เป็นจุดเริ่มต้นของโชคชะตาระหว่างเธอกับผู้ใช้ไฟ...

คดีฆ่าตัวตายหมู่เขาฟุตาโกะยามะ, คดีกะโหลกสีทอง, ศพไร้หัว, คำสารภาพบาปเรื่องฆาตกรรมและนักเขียนผู้ล่วงลับ คดีทั้งหลายที่เหมือนไม่เกี่ยวข้องกัน แต่แท้จริงแล้วนั่นคือคดีเดียวกันและยังเกี่ยวพันถึงยุคเทพเจ้าของญี่ปุ่นอีกด้วย บัดนี้ การปัดรังควานโดยชายชุดดำ "เคียวโกะคุโด" ที่ใช้วัด ณ สึชิเป็นฉาก กำลังจะเริ่มขึ้น

แฟรงค์เก็นสไตน์แมรี่หลบหนีออกมาเพื่อตามหาไวโอเล็็ต ลูกสาวอันเป็นที่รัก แต่แจ็คเดอะริปเปอร์ก็ตามมาลอนดอนเพื่อที่จะฆ่าเธออีกครั้ง ฟิวรี่จะสามารถช่วยแมรี่ให้จากไปอย่างสงบได้หรือไม่ การต่อสู้ที่ดุเดือดระหว่างเขากับแจ็คกำลังเริ่มเปิดฉากขึ้น

อิสึมิ ชัตสิกิ นักเรียนใหม่ผู้มีดวงตาหม่นหมอง ชิโร่ ผู้ที่แม่ถูกสังหาร กับชัตสึกิผู้มีพ่อเป็นฆาตกร แม้ทั้งคู่จะกระทบกระทั้งกัน แต่ก็ดึงดูดกันและกันด้วย ทว่า เงาของเรียวเด็กหนุ่มผู้เต็มไปด้วย ความคลุ้มคลั่งแสนน่าสะพรึงกลัว กลับคืนคลานเข้าใกล้ซัตสึกิมากขึ้นเรื่อยๆ!?

เซบาสเตียนขอรับ  พ่อบ้านของท่านไงขอรับ เซบาสเตียนที่ถูกเคียวยมทูตของสัปเหร่อฟัน ภาพที่หลังไหลออกมาจากบาดแผลนั้น  ฉายภาพซ้ำถึงการพบกันกับชิเอลเป็นครั้งแรก  เจ้านายและพ่อบ้านมือใหม่หมุนวนความทรงจำสีซิเปียเล่าเรื่องราว...เล่าเรื่องราว การ์ตูนเกี่ยวกับหัวหน้าคนรับใช้ที่มีสีเลือดมากที่สุดมาถึงมือคุณแล้ว

" ฟุรุฮาตะ" ผู้ทำงานพร้อมอยู่อาศัย ณ โบสถ์คริสต์ รับฟังเรื่องปรึกษาจาก "ชิราโอกะ" ผู้เป็นพระประจำโบสถ์ เรื่องปรึกษาที่ว่าคือเรื่อง "เหล่าพระชินโตเนื้อตัวเปรอะเปื้อนที่ตามหากระดูก" อีกด้าน "อิซาเมะ" ซึ่งออกเดินทางมายังสึซึเพื่อตกปลา ก็ได้เห็นรูปที่ "อิเคมิ" หญิงสาวผู้เคยพบหน้าค่าตากันมากำลังถูกตำรวจจับ อดีตทั้งหลายที่เกี่ยวพันกับกระดูก "คดีกะโหลกสีทอง" ณ อ่าวสึชิ ปริศนาเกี่ยวกับกะโหลกทั้งหลาย มีแต่จะลึกลับขึ้น

นักสืบสาวคนสวย โฮโช เรโกะ ประจำสถานีตำรวจคุนิทาจิ เธอเป็นบุตรสาวคนเดียว ของประธานโฮโชกรุ๊ปอันเลื่องชื่อ วันหนึ่ง มีการพบศพของหญิงสาว ภายในบ้านพัก ทั้งที่ยังสวม บู๊ท เมื่อเรโกะเจอททางตัน เธอจึงต้องขอคำปรึกษาจากคาเงยามะ คุณพ่อบ้านผู้มีพรสวรรค์ใน การไขปริศนา...!?

ณ หมู่บ้านฮิดะ หมู่บ้านถูกสาปที่เกิดเหตุคดี หญิงสาวหายตัวขึ้นไม่หยุดหย่อน ชิโร่ใช้ "พลังการมองอดีต" เข้าประจันหน้าปริศนานั้น แต่แล้วสิ่งที่เขาได้รู้ กลับเป็นความจริง อันน่าสะพรึงกลัว.. และแล้ว เด็กหนุ่มผู้เต็มไปด้วยความมาดร้ายก็ปรากฏตัวขึ้นตรงหน้าชิโร่--- ชิโร่จะใช้ "พลังการมองอดีต" ปัดเป่าความมืดนี้ไปได้หรือไม่---!? ดาร์คมิสเทรี่ ที่เต็มไปด้วยเสียงร้องไห้ มาสู่เล่ม 4 แล้ว!